Keunikan lain yaitu dari segi perpaduan warna, karena Masjid ini di dominasi dengan warna merah, hijau, kuning, biru, dan putih. Arti warna merah, kuning, hijau dan putih pada bangunan Masjid ini merupakan cerminan dari budaya Tionghoa.
Yang mana warna merah sebagai simbol bahagia, kuning sebagai kemasyhuran, biru sebagai harapan dan hijau untuk kemakmuran.
Adanya Masjid Muhammad Cheng Ho Jember dengan gaya Tionghoa menjadi ikon baru sehingga semakin banyak dikenal dan merupakan bukti pemersatu budaya.***